Ekoenergian voimassa olevissa kriteereissä todetaan vesivoimasta seuraavaa:

"Ekoenergia-merkki myönnetään vesivoimalla tuotetulle sähkölle seuraavin kriteerein:

Vesivoimalaitoksen tulee olla valmistunut ennen vuotta 1996. Tämän jälkeen toteutetut tehostamistoimenpiteet Suomen luonnonsuojeluliitto hyväksyy tapauskohtaisesti.

Energiayhtiön hakiessa vesivoimalaitoksen sähköntuotannon liittämistä Ekoenergia-merkin piiriin Suomen luonnonsuojeluliitto voi asettaa energiayhtiölle liittämisen ehdoksi kalatien rakentamisen. Ehdon asettamisesta päätetään yhteistyössä energiayhtiön ja asiantuntijatahojen kanssa.

Sähkön vähittäismyyjän on rahastoitava vesivoimalla tuotetusta, Ekoenergia-merkittynä myydystä sähköstä 0,008 snt/kWh ympäristörahastoon, jolla vähennetään vesivoiman ympäristöhaittoja.

Vesivoimalla sähköä tuottavan yhtiön on toimitettava Suomen luonnonsuojeluliitolle selvitys vesivoimalaitoksen teknisistä tiedoista, luvista ja ympäristövaikutuksista sekä mahdollisista toteutetuista ympäristönsuojeluhankkeista. Tiedot tulee päivittää tilintarkastuksen yhteydessä.

Vesivoimayhtiön tulee toteuttaa lupaehdoissa määrätyt velvoitteet."